| 単巻（KCDX275・1992/2/6） | ||
| ROUND1 （ジャパンコース） | コミックボンボン1991年10月号掲載 |
| ROUND2 （オーストラリアコース フランスコース） | コミックボンボン1991年11月号掲載 | |
| ROUND3 （ハワイコース） | コミックボンボン1991年12月号掲載 | |
| ROUND4 （UKコース） | コミックボンボン1992年1月号掲載 | |
| 1巻（KCDX375・1993/2/6） | ||
| ROUND1 ボンボン杯レース（予選ヒート） | コミックボンボン1992年10月号掲載 |
| ROUND2 ボンボン杯レース（決勝ヒート） | コミックボンボン1992年11月号掲載 コミックボンボン1992年12月号掲載 | |
| ROUND3 スペシャル杯レース | ||
| 2巻（KCDX396・1993/6/5） | ||
| ROUND1 ピーチ姫争奪杯〔前編〕 | コミックボンボン1993年1月号掲載 |
| ROUND2 ピーチ姫争奪杯〔後編〕 | コミックボンボン1993年2月号掲載 | |
| ROUND3 夢のお宝さがし杯〔前編〕 | コミックボンボン1993年3月号掲載 | |
| ROUND4 夢のお宝さがし杯〔後編〕 | コミックボンボン1993年4月号掲載 | |
| GO! GO! マリオペイント | ||
| 3巻（KCDX426・1993/11/6） | ||
| ROUND1 弾丸男Ｚ登場の巻 | コミックボンボン1993年5月号掲載 |
| ROUND2 ピーチがピンチにならないとＺはあらわれないの巻 | コミックボンボン1993年6月号掲載 | |
| ROUND3 Ｚの正体がすこしだけわかるの巻 | コミックボンボン1993年7月号掲載 | |
| ROUND4 Dr.の参戦でＺがめだたなくなるの巻 | コミックボンボン1993年8月号掲載 | |
| 1巻（KCDX451・1994/3/5） | ||
| ショット1 スーパースコープ発射の巻 | コミックボンボン1993年9月号掲載 |
| ショット2 デンジャラスラブの恐怖の巻 | コミックボンボン1993年10月号掲載 | |
| ショット3 シーサイドトラップをやぶれの巻 | コミックボンボン1993年11月号掲載 | |
| ショット4 アイスマウンテン大激戦の巻 | コミックボンボン1993年12月号掲載 | |
| マリオペイント ルイージ殺人事件（前編） | ||
| 2巻（KCDX469・1994/6/6） | ||
| ショット1 命ぎりぎりフライングバトルの巻 | コミックボンボン1994年1月号掲載 |
| ショット2 心ドキドキ霊感アタックの巻 | コミックボンボン1994年2月号掲載 | |
| ショット3 頭くらくら四連装カメ砲台の巻 | コミックボンボン1994年3月号掲載 | |
| ショット4 根性バリバリ最終決戦!!の巻 | コミックボンボン1994年4月号掲載 | |
| マリオペイント ルイージ殺人事件（後編） | ||
| 1巻（KCDX682・1996/2/6） | ||
| 空からおちてきたベビーマリオの巻 | コミックボンボン1995年9月号掲載 |
| ハードにかけぬけろ！ アスレチックコースの巻 | コミックボンボン1995年10月号掲載 | |
| ステキなバカ犬ポチ登場!!の巻 | コミックボンボン1995年11月号掲載 | |
| 雪山はさむいぞ すべるぞ てんやわんや!!の巻 | コミックボンボン1995年12月号掲載 | |
| 2巻（KCDX703・1996/6/6） | ||
| ヨッシー全員集合 ベビーを救え!!の巻 | コミックボンボン1996年1月号掲載 |
| ヒーローベビー あしたのためにそのいちの巻 | コミックボンボン1996年2月号掲載 | |
| 最終決戦 究極のモーフィングの巻 | コミックボンボン1996年3月号掲載 | |
| バトルふたたび あとの祭りは盛大に！の巻 | ボンボン95年冬の増刊号掲載 | |
| 3巻（KCDX742・1996/10/5） | ||
| キノコ城大パニック ヨッシー救助隊出動!!の巻 | コミックボンボン1996年4月号掲載 |
| 作戦不可能!? 暴走超特急を救え!!の巻 | ボンボン96年春の増刊号掲載 | |
| 未確認生命物体!? 巨大岩礁を破壊せよ！の巻 | コミックボンボン1996年5月号掲載 | |
| 真夜中のあなた サヨナラわたちの救助隊！の巻 | コミックボンボン1996年6月号掲載 | |
| 1巻（KCDX751・1996/11/6） | ||
| マリオA 夢スタート！ NINTENDO64 攻略修行編 | コミックボンボン1996年7月号掲載 |
| マリオB 復活の魔王クッパ！ 絵の中の悪魔がひそむキノコ城 | コミックボンボン1996年8月号掲載 | |
| マリオC ペンギン大追跡！ 闇の世界のクッパを倒せ!! | ボンボン96年夏の増刊号掲載 | |
| マリオD スーパーマリオ64 コマヨンサービス笑劇場 | ボンボン96年夏の増刊号掲載 | |
| 2巻（KCDX770・1997/1/8） | ||
| マリオA ホラーハウス大捜査線 ピーチ姫はどこだ!? | コミックボンボン1996年9月号掲載 |
| マリオB はばたけマリオ！ ピラミッド上空到達せり!? | コミックボンボン1996年10月号掲載 | |
| マリオC メタルマリオはチョー無敵！ 毒ガスの洞くつをさぐれ!! | コミックボンボン1996年11月号掲載 | |
| マリオD 対決 炎の海のクッパ！ 溶岩の波にノリノリ〜!! | コミックボンボン1996年12月号掲載 | |
| 3巻（KCDX812・1997/6/6） | ||
| マリオA 輝く星をつかめ!! スノーマンズランド！ | コミックボンボン1997年1月号掲載 |
| マリオB 心に愛はあるのかい!? ひとつ絵の中で!! | コミックボンボン1997年2月号掲載 | |
| マリオC ウッキーな二人旅！ マウンテンハイクでGO!! | コミックボンボン1997年3月号掲載 | |
| マリオD ちびデカ大パニック！ 巨大ハナちゃんを倒せ!! | コミックボンボン1997年4月号掲載 | |
| 4巻（KCDX852・1997/9/5） | ||
| マリオA ファイナルバトル1 悪夢の時計台 時間よ止まれ！ | コミックボンボン1997年5月号掲載 |
| マリオB ファイナルバトル2 天空超バトル 逆襲のクッパ!! | コミックボンボン1997年6月号掲載 | |
| マリオC ファイナルバトル3 逃げちゃダメだ×10 真マリオ起つ!! | コミックボンボン1997年7月号掲載 | |
| マリオD 64マリオカート編突入!! ノンストップのボンバーパニック!! | ボンボン96年冬の増刊号掲載 | |
| 5巻（KCDX906・1998/3/6） | ||
| マリオA 「ぴーちっち」をつかめ!! キノピオ・ハイウェイ！ | コミックボンボン1997年8月号掲載 |
| マリオB 砂煙舞う海岸線!! ノコノコ島の大熱戦！ | コミックボンボン1997年9月号掲載 | |
| マリオC いきなりタイムスリップ!! ロストワールドをかけぬけろ！ | コミックボンボン1997年10月号掲載 | |
| マリオD トップはわたさない!! ピーチ姫の特設コース！ | コミックボンボン1997年11月号掲載 | |
| 1巻（KCDX939・1998/6/5） | ||
| 第1話 はじまり はじまり 絵本の中で珍道中!! | コミックボンボン1998年1月号掲載 |
| 第2話 とうさん象さん 通さんゾウ！ | コミックボンボン1998年2月号掲載 | |
| 第3話 ホネホネ竜さん ホネおれぞん！ | コミックボンボン1998年3月号掲載 | |
| 第4話 ムシャくちゃに弱い ムシャムシャさん | コミックボンボン1998年4月号掲載 | |
| 2巻（KCDX962・1998/8/6） | ||
| 第5話 にゅ〜とおでまし入道さま | コミックボンボン1998年5月号掲載 |
| 第6話 イソズキンちゃん 気をつけて！ | コミックボンボン1998年6月号掲載 | |
| 第7話 無敵！ 緑ヨッシーのスーパーしあわせのほほえみ | コミックボンボン1998年7月号掲載 | |
| 番外編 マリオの瞼の父はいずこ!? | コミックボンボン1997年12月号掲載 | |